Избранный. Интервью с легендарными современниками
Шрифт:
Карина Сарсенова
– А что такое микробиота, микробы в экологическом контексте? Наверное, микробы заселяют не только человека, если они появились раньше других видов живых существ на Земле, видимо, они заселяют и почву, и водные ресурсы, и воздушное пространство.
Валерий Даниленко
– Да, именно так оно и есть. И мои первые научные исследования были связаны с изучением экологической системы микробиоты, тогда она так не называлась, с изучением микробиоты почв. Действительно в почве, воде, в морях, океанах и в реках присутствует огромное количество разнообразных бактерий. Сегодня мы будем говорить о тех бактериях, которые приносят человеку
Карина Сарсенова
– Это так называемые компенсальные бактерии?
Валерий Даниленко
– Да, если это касается человека, то речь идёт о компенсальных бактериях, тех, которые с ним существуют и живут всё время. А в почве, в каждом грамме почвы тоже находится около миллиарда бактерий, в основном это так называемые актинобактерии, которые продуцируют практически все известные нам антибиотики. Их можно выделить из почвы, из моря. Мы все знаем стрептомицин – первый, пенициллин, тетрациклины, хлорамфениколы и многие другие, а то, что нам неизвестно сейчас – это полусинтетические производные на их основе, это, так скажем, торговое наименование, тот же самый сумамед или азитромицин, то, что сейчас очень эффективно используется для лечения различных заболеваний от грамположительных бактерий. Поэтому они, помимо антибиотиков, являются источниками многих других биологически важных и нужных веществ, которые добываются, производятся в нашей биотехнологической промышленности, в области красной биотехнологии.
Карина Сарсенова
– А что это такое?
Валерий Даниленко
– Биотехнология подразделяется на несколько направлений. Я упомянул красную биотехнологию. Это использование бактерий и процессов их выращивания, ферментации для получения лекарств. Это медицина. Зелёная биотехнология – это использование бактерий для получения различных веществ: аминокислот, витаминов и так далее – для сельского хозяйства, пищевой промышленности. Классическая биотехнология тесно связана с использованием методов генной инженерии и самых современных методов метогеномики и протеомики. Все направления вошли во все области исследования.
Карина Сарсенова
– Если мы вернёмся к компенсальным бактериям, которые живут в человеческом организме, на человеке, в человеке, что-нибудь интересное Вы можете нам рассказать об этих видах бактерий? Кто же живёт с нами и в нас?
Валерий Даниленко
– Да, конечно. То, что становится известно в последние годы, поражает не только самих учёных неожиданностью и новизной, это поражает и людей, которые этим интересуются, сталкиваются в жизни. Что такое ген, что такое генная инженерия, что такое секвенирование генома – это сейчас уже знают все. То, что у нас живут бактерии, было известно давно.
Сейчас для систематизации, более подробного исследования тело человека разделено на 18 полостей, в которых живут и существуют бактерии, принося ту или иную пользу для нашего организма. Три из 18 полостей – наиболее важные для здоровья человека. Это желудочно-кишечный тракт, где живёт значительная часть бактерий. Я упоминал, их там от двух до трёх килограммов. Это ротовая полость, которая тоже важна для жизнедеятельности человека, и вагинальная полость у женщин, где в основном обитают лактобациллы, их несколько десятков видов. Конечно же, там присутствуют и условно патогенные и патогенные бактерии. О важности этих бактерий для возникновения проблем деторождения, здоровья женщины мы поговорим позже.
Если вернуться к бактериям, которые живут в желудочно-кишечном тракте, то там их обнаруживается до 1000 видов. 1000 видов разных бактерий! Но нужно понимать,
Карина Сарсенова
– Что такое штамм?
Валерий Даниленко
– Штамм – это вариант отличия одного вида или его вариации или подвида бактерий от другого.
Карина Сарсенова
– Подвид?
Валерий Даниленко
– Подвиды тоже есть у бактерий. У каждого человека есть примерно по 100 видов бактерий, и по соотношению все люди, живущие на Земле – в Соединённых Штатах, Европе, Японии, России, – имеют, если говорить о крупной классификации, по три-четыре основных энтеротипа. Это большие группы бактерий.
Детальные исследования показали, что на самом деле нет ни одного человека, бактерии которого были бы похожи на бактерии других людей. Мы в этом отношении, если смотреть по комбинациям генов, по штаммам, очень индивидуальны. Возможно, только близкие родственники имеют определённое сходство. Это было доказано при изучении однояйцевых близнецов и других методов исследований. Поэтому наше богатство – наш генофонд, которым мы все должны дорожить, и хранить генофонд индивидуальный, сложившийся у нас с рождения.
Карина Сарсенова
– Это код нашего здоровья.
Валерий Даниленко
– Это код нашего персонального здоровья. Мы говорим о персонализированной медицине, о том, что она приходит. Она уже пришла, используется при лечении различных заболеваний – и онкологических, и иммунных, и других. По генотипу люди, живущие на Земле, мало отличаются друг от друга. Но на уровне микробном, микробиоты, на уровне композиции генов, которых, ещё раз напоминаю, в 100 раз больше, чем наш геном, наблюдаются значительные отличия.
Карина Сарсенова
– Валерий Николаевич, в чём суть этих отличий? В питании, в социальной среде человека?
Валерий Даниленко
– Суть этих отличий изучает наука, которая сейчас находится в стадии бурного развития, и мы можем говорить о том, что знаем на сегодняшний день, предполагая, что может быть завтра. Отличия складываются по нескольким параметрам. Первое – это наш генотип. Второе – это наше питание. Третье – это наш культурный образ жизни, санитарный и так далее. И четвёртое – это социальные условия, социальные стрессы, в которых мы находимся. И ключевым, важнейшим моментом является применение антибиотиков, которое сказывается на отборе тех или иных штаммов бактерий.
Карина Сарсенова
– Это негативное влияние?
Валерий Даниленко
– Это негативное влияние, да. Но в прошлом году мы опубликовали работу в известном европейском журнале «Микробная экология», где при изучении и сравнении генов у одного из классических пробиотических бактерий переходим к пробиотикам постепенно, это bifidobacterium longum, выделенные из российского человека. Мы первоначально обнаружили более 35 генов, которые потом показали присутствие только в популяции людей, живущих в центральном регионе России. Таких генов нет ни в Европе, ни в Японии, ни в Америке, но там есть свои. И, как мы предполагаем, эти гены были сформированы благодаря этнокультурным особенностям данной популяции: питание, условия жизни и так далее. Недавно мы провели аналогичную сравнительную работу по изучению бифидобактерий lactobacillus, пробиотически выделенных из жителей Казахстана, из казахов конкретно, и сравнили их с выделенными из россиян, и тоже нашли определённые отличия, связанные с условиями питания, условиями жизни.